Group of Data Modeling, Computational Biology and Predictive Medicine

IBENS



Axe 2 : Approches quantitatives à l'exploration du comportement et de la cognition

Axe 3 : Réseaux neuronaux, modélisation et intelligence artificielle

Exploration des interactions multi-échelles des processus neuronaux

L'équipe explore les interactions multi-échelles des processus neuronaux, de la molécule aux régions cérébrales, via modélisation mathématique, IA, et simulations.

Nous développons des algorithmes en temps réel pour prédire les états cérébraux durant l’anesthésie ou le coma et décoder les activations dans les réseaux neuronaux. Nous étudions aussi l'impact des processus stochastiques sur la réponse cérébrale.

publications majeures au cours des 5 dernières années, incluant le Pubmed ID

Perochon, T., Krsnik, Z., Massimo, M. et al…D. Holcman, Unraveling microglial spatial organization in the developing human brain with DeepCellMap, a deep learning approach coupled with spatial statistics. Nat Commun 16, 1577 (2025). https://doi.org/10.1038/s41467-025-56560-z

Zonca L, Bellier FC, Milior G, Aymard P, Visser J, Rancillac A, Rouach N, Holcman D. Commun Biol. 2025 Jan 24;8(1):114. doi: 10.1038/s42003-024-07390-0. PMID: 39856404 Unveiling the functional connectivity of astrocytic networks with AstroNet, a graph reconstruction algorithm coupled to image processing.

Loison V, Voskobiynyk Y, Lindquist B, Necula D, Longrois D, Paz J, Holcman D. Neuroimage. 2024 Jan;285:120498. doi: 10.1016/j.neuroimage.2023.120498. Epub 2023 Dec 20. PMID: 38135170 Mapping general anesthesia states based on electro-encephalogram transition phases.

Mc Hugh J, Makarchuk S, Mozheiko D, Fernandez-Villegas A, Kaminski Schierle GS, Kaminski CF, Keyser UF, Holcman* D, Rouach* N. Nanoscale. 2023 Jul 27;15(29):12245-12254. doi: 10.1039/d2nr03475a. PMID: 37455621 Diversity of dynamic voltage patterns in neuronal dendrites revealed by nanopipette electrophysiology.

Basnayake K, Mazaud D, Kushnireva L, Bemelmans A, Rouach N, Korkotian E, Holcman D. Sci Adv. 2021 Sep 17;7(38):eabh1376. doi: 10.1126/sciadv.abh1376. Epub 2021 Sep 15. PMID: 34524854 Nanoscale molecular architecture controls calcium diffusion and ER replenishment in dendritic spines.

Adresse :
46 Rue d'Ulm, 75005, Paris

Responsable équipe :
Holcman David
Nom du Co-responsable équipe :

Nom du Contact administratif :


Site web : Cliquez ici
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